El modelo de investigación de la UML, fomenta la actividad investigativa en los sectores estudiantiles y docentes de la universidad en respuesta a las necesidades socio económicas del país. La investigación se rige a través de reglamentos, normas y procedimientos en los diversos programas académicos de la institución. La educación es la base para el desarrollo social y cultural sostenible, es también el fundamento para impulsar el avance en las actividades productivas de bienes y servicios, de igual manera, es la promotora de los cambios tecnológicos y que, además garantiza la preservación y consolidación de los valores morales, éticos y cristianos, con el establecimiento de políticas que sirvan de guía para el progreso y estabilidad de la sociedad. Para lograr esos avances son indispensables los proyectos de investigación que generen nuevos conocimientos y que beneficien a la comunidad.
EL Modelo Institucional, contiene las siguientes políticas generales:
La investigación está plenamente articulada con la docencia y la extensión social; asimismo, con los planes de desarrollo municipal, departamental, regional y el Plan de Desarrollo Humano
Se promueven iniciativas de investigación conjuntas entre el sector público y privado, que abarquen a las pequeñas y medianas empresas.
Se privilegia la investigación aplicada y se crean condiciones para la investigación científica en el mediano y largo plazo.
Se promueve la investigación como eje transversal en el currículo de grado y postgrado.
Se articulan acciones en todas las disciplinas en el marco de políticas nacionales, regionales e internacionales de investigación y desarrollo.
Se promueve, genera y difunde conocimientos por todos los medios de comunicación posibles.
Se respeta el marco legal del país que pudiera afectar en los procesos de investigación.
Se promueve la conformación de equipos de investigación que exploren los temas contemporáneos de valor cognoscitivo y social.
Se promueven investigaciones sobre los problemas ambientales, gestión de riesgo y cambio climático.